患上子宫内膜异位症，B超发现了卵巢上有巧克力囊肿，很多患者都会问，能不能观察，或者药物治疗，能不能通过穿刺吸除巧囊液，目前协和医院乃至国际上比较一致的意见是，如果从来没有针对内膜异位症治疗过，从来没有做过手术，巧囊超过5cm，或者有严重的痛经，或者有生育能力受损证据的患者，卵巢巧克力囊肿的首选治疗方式仍是手术治疗，原因如下：

　　(1) 一旦子宫内膜异位症已经形成一定规模的囊肿，即巧克力囊肿，药物治疗是不敏感的，临床上很难通过药物消除囊肿，甚至可以说是不能完成的任务。如果您看到有偏方，中药，或者什么药物灌肠能够承诺消除巧克力囊肿的广告或者信息，一定注意甄别，但是确实有患者说，我的囊肿小小的，吃了神医开的药，消失了，那么，可以大致判断，该囊肿十有八九不是巧克力囊肿，而是生理性囊肿，在成年女性非常常见，一般，不经任何治疗，3-6个月多会自然消失。

　　(2)有些患者害怕手术，拒绝手术，不知不觉中可能把囊肿“养”的很大，巧囊不积极治疗，非常容易发生月经前后时期的自发破裂，类似急腹症，逼迫患者急诊就诊，在个别缺乏治疗经验的医院，对这种新型急腹症的认识不足，通常为患者进行剖腹探查手术，而此时，囊肿多伴有严重的炎症反应，手术不容易将囊肿剥除干净，甚至导致一侧卵巢的完全切除，患者的损失比较大。

　　(3)医生给出巧克力囊肿的诊断，都只能说是一个大概的诊断，并非每个患者肚子里的囊肿都是巧克力囊肿，很有可能是性质更恶劣，或者对身体危害更大，更加影响身体健康的肿瘤，手术，能够切除肿瘤，进行病理学检查，这是确诊肿瘤性质的唯一金标准。

　　(4) 巧囊和卵巢子宫内膜样癌，透明细胞癌关系密切，巧囊恶变率约为1%，手术可以除外巧囊恶变，或者避免夜长梦多，避免病程时间长，囊肿性质的变化。

　　(5) 手术能够较为彻底的清除盆腔包块，缓解痛经，提高患者的生活质量。

　　(6)对于有不孕症问题的患者，手术后患者的妊娠率能够得以提高，多数患者在术后半年能够自然怀孕。

　　而针对手术后复发的巧囊，在基本除外巧囊恶变的情况下，如果患者对再次手术有顾虑，可以考虑B超引导下穿刺抽吸巧囊液，还可以配合灌注无水乙醇等药物，减少囊内液的分泌，促进囊肿粘连闭合。